近亲繁殖而且血统建设
测量近亲繁殖父母之间的血缘程度是血缘数据的另一个重要应用。的近交系数(F)用来定义2的概率等位基因S将是相同的，并且来自同一个祖先。这一原理的应用最容易用例子来说明。如果一对兄弟姐妹结婚，他们的后代将有四分之一的机会从父母那里继承一对相同的等位基因祖父母。血缘关系每增加一级，这种可能性就减少一半，因此，姨妈和侄子交配的孩子出现相同等位基因的可能性为八分之一，表亲的孩子出现相同等位基因的可能性为十六分之一。
在建设中血统S，水平线用来连接兄弟姐妹和配偶的符号，垂直线用来连接父母和他们的后代，所有的近亲交配都有一个或多个循环，每个循环都涉及血缘关系。一个个体的近交系数是包括其父母在内的所有循环的近交系数的总和。一个种群的近交系数是由平均值计算出来的F其成员的价值观。高值F在小群体中发现，这些群体的成员在许多代中相互结婚。这样的群体被称为隔离。因此,撒玛利亚人自8世纪以来，他们一直是一个小而独特的群体公元前在相当程度上是近亲繁殖的美国一些宗教团体也孤立地生活在农业殖民地(例如，宗教团体亚米希人和哈特教派信徒s).除了这些数量上较小的群体，严格的社区内婚姻深受许多人的青睐中东、中环及南亚以及北非和撒哈拉以南非洲地区。在很多情况下社区在美国，这一代人的婚姻中，有20%到60%以上是家族内部的婚姻，最常见的是表亲之间的婚姻。
纯合性而且杂合性
在遗传学一个等位基因在一双鞋的相同位置上携带的染色体S被称为纯合子。等位基因在一般人群中可能是罕见的，但是，如果父拥有它，它从父母传递给孩子的概率与任何普通等位基因相同。因此，在近亲交配的后代中，获得来自母亲和父亲的罕见等位基因的机会最大，即等位基因纯合的机会最大。理论上，自重复突变S是罕见的，即使是普通等位基因的纯合性也可能归因于远亲关系。（看到纯合子．)
孟德尔继承
奥地利植物学家，教师，奥古斯丁高级教士孟德尔他对豌豆的经典实验和随后的大量工作表明，当一个等位基因出现在两条染色体上(纯合)时，其效果可能与只从一个亲本的一条染色体上遗传(杂合)的效果非常不同。在医学遗传学中有很多蛋白质年代,特别是酶S，如果其中一条染色体携带适当的等位基因，它们就会产生足够的数量。在这两个等位基因中，该基因的缺失会导致它所决定的蛋白质的缺乏，并导致罕见疾病和疾病异常这种情况通常在近亲结合的后代中更为常见。1902年，孟德尔定律被重新发现后不久，有先天性代谢错误的个体的父母中血缘关系的高频率被用作孟德尔定律的证据隐性孟德尔遗传在人类身上。其中一个注意到的缺陷是白化病在这种情况下，受试者的皮肤呈粉红色，头发呈白色，眼睛缺乏色素，在强烈的阳光下会感到不适。在近亲结合的后代中，这种性质的特定遗传效应只有在罕见的情况下才明显遗传疾病;一种疾病的发生越罕见，父母之间的近亲关系就越频繁。
死亡率
据报道，20%至35%的一级近亲交配的后代，无论是兄妹、父女还是母子，都有过高的死亡率和严重的儿童缺陷。非遗传影响，如年轻母亲年龄，可能在很大程度上导致这些不良结果。表亲婚姻的后代死亡率比非近亲婚姻的后代高3.5%至4.5%，出生缺陷增加2%至3%。在更遥远的层面上近亲繁殖，相应的，死亡和缺陷的发生率较低。由于致病基因的罕见性是一个重要因素，近亲繁殖的整体影响在西方人群中趋于有限，近亲结合通常不常见。在近亲婚姻优先的地方，遗传性疾病虽然许多近亲夫妇不利的社会人口环境是主要的致病因素，但对整个疾病概况有重大影响。
有利的杂合性
杂合子形式，没有不良对携带者的影响，是隐性的等位基因有可能导致未来因遗传疾病而死亡。实际上，近亲父母的婴儿后代的死亡清洗基因库并降低了隐性疾病基因在后代中表达的可能性。原则有意近亲繁殖用于家畜以消除隐性等位基因。然而，即使在高度自交系的“纯”系中，健康问题也确实存在，某种程度的等位基因杂合度似乎是有利的。许多物种，包括人类，都是通过隔离、近亲繁殖和近亲繁殖的过程建立起来的，而且它们显然是以这种方式茁壮成长的。
的历史意义
一级近亲婚姻在许多早期社会中都有实行，包括18世纪和19世纪的埃及王朝，琐罗亚斯德教伊朗,印加帝国和夏威夷统治阶级。相比之下，所有现代人类社会都有某种形式的乱伦禁忌．这些规则和法律禁止某些人之间的婚姻或性关系，或两者兼而有之亲属．这些亲族总是包括一些近亲阶级，建立乱伦法背后的一个理论假设，民间知道近亲结合对后代的不良近亲繁殖影响。在不同的社会中，近亲繁殖被禁止的程度存在着相当大的差异，禁忌可以延伸到非近亲关系。例如，在传统的中国社会，一个男人可以娶他母亲的兄弟的女儿，但男女之间的婚姻也一样姓是被禁止的。因此，乱伦起源的其他理论包括对乱伦的影响的分析稳定的家庭作为一个经济和教育单位，并将各种社会对乱伦的定义归因于社会和心理动机。
艾伦·h·比特斯