的别动队组织以及他们的移动杀手同伴
进入被征服的苏联领土国防军(德国武装部队)是3000人别动队组织(“部署组”)，特种机动杀伤部队。他们的任务是杀害犹太人，苏联政委，还有罗马在被军队征服的地区。独自或在当地警察的帮助下，当地的反犹太人口，并陪同轴特别行动队会进入一个城镇，围捕他们的受害者，把他们赶到城镇郊区，然后射杀他们。他们以家庭为单位杀害犹太人。外基辅，乌克兰的峡谷里泛神教义纱线1941年9月28日至29日，一个特别行动队在德国杀害了33771名犹太人。在隆布拉森林外贫民窟在里加，拉脱维亚在美国，2.5万至2.8万犹太人在11月30日和12月8日至9日被枪杀。从1941年夏天开始，特别行动队在维尔纳城外的波纳里(Ponary)杀害了7万多名犹太人维尔纽斯)立陶宛．他们在第九堡屠杀了9000名犹太人，其中一半是儿童，相邻到科夫诺(现在考纳斯)，立陶宛。
大规模枪击事件有增无减，先是一波，接着是第二波。当屠杀在苏联的反攻下结束时，特种部队回来挖出死者并焚烧他们的尸体以销毁犯罪证据。据估计，特别行动队杀害了140多万人，其中大多数是犹太人。
有时仅仅是德国军队在附近的存在就足以引发一场大屠杀。一个例子是在波兰的耶德瓦布内村发生的事情，那里的邻居谋杀了他们的犹太邻居。多年来，这场大屠杀一直被归咎于德国人，尽管许多波兰人可能知道，当地人已经开始反对自己的犹太人。在波罗的海地区，德国人被一部分人视为解放者，政治独立的诱惑和消除与前苏联占领者任何合作的愿望导致民族主义团伙杀害了当地犹太人。
历史学家对这些流动杀戮组织成员的动机存在分歧。美国历史学家克里斯托弗·勃朗宁(Christopher Browning)描述了这样一支部队，101警察营，他们是处于特殊环境中的普通人整合逐渐克服了同辈压力、名利场主义、服从命令和群体团结道德压抑。美国作家丹尼尔·戈德哈根(Daniel Goldhagen)将同一单位视为“自愿的刽子手”，分享希特勒种族灭绝的愿景反犹太主义发现他们的任务不愉快，但却是必要的。的多样性对戈德哈根的观点提出了挑战，即杀人动机是德国反犹太主义的一种独特形式。然而布朗宁和戈德哈根同意如果这些凶手请求宽恕，没有人会受到惩罚。个人可以选择是否参与。几乎所有人都选择成为杀手。
的灭绝集中营
1942年1月20日，莱因哈德·海德里希召开的湖会议在湖边别墅柏林组织“最终的解决方案犹太人的问题。”桌子周围坐着15个代表政府机构的人实现如此大胆和全面的政策。会议的语言很明确，但会议记录却很谨慎:
这个问题的另一个可能的解决办法现在已经取代了移民，即犹太人撤离到东方。……目前已经在收集实际经验，这对将来最终解决犹太人问题是极为重要的。
参与者理解“向东疏散”的意思驱逐出境去杀戮中心。
1942年初，纳粹在特雷布林卡，索比堡,Belzec在被占领的波兰．死亡集中营是“最终解决方案”的重要工具。特别行动队是来杀他们的受害者的。在杀戮中心，这个过程正好相反。受害者被火车(通常是用牛车)带到凶手那里。灭绝营变成了高效地生产尸体的工厂，对德国人的身体和心理损失最小。得到了乌克兰和拉脱维亚合作者的协助战俘在美国，几个德国人每月就能杀死数万名囚犯。在Chelmno这是第一个灭绝营，纳粹使用的是移动煤气车。在其他地方，他们建造了永久的毒气室和尸体焚烧的火葬场有关。一氧化碳是大多数营地的首选气体。环酮b一种特别致命的杀伤剂，主要用于奥斯维辛集中营后来又在马伊达内克。
奥斯维辛集中营，也许是最臭名昭著的致命的集中营它实际上是三个集中营合二为一:一个战俘营(奥斯维辛一号)，一个集中营灭绝营(Auschwitz II-Birkenau)和一个奴隶劳动营(Auschwitz III-Buna-Monowitz)。一到监狱，犹太囚犯就面临着所谓的Selektion．一位德国医生负责挑选孕妇、小孩、老人、残疾人、病人和体弱多病的人，让他们立即死在毒气室里。必要时，德国人挑选身体健全的囚犯强迫劳动在奥斯维辛集中营附近的工厂里，一家德国公司IG Farben德国仅在1942年就投资了7亿德国马克来利用强迫劳动，这是一项资本投资。该公司假定奴隶劳动将成为德国经济的永久组成部分这些囚犯被剥夺了足够的食物、住所、衣服和医疗，实际上是被累死的。他们会时不时地面对另一个Selektion．纳粹会把那些不能工作的人转移到比克瑙的毒气室。
而在奥斯维辛集中营和Majdanek为了支持德国的战争，纳粹将囚犯用作奴隶劳动Belzec，特雷布林卡,索比堡只有一个任务:杀人。特雷布林卡有120名员工，其中只有30人党卫军(纳粹准军事部队)在集中营运营的17个月里，约有75万至92.5万犹太人被杀害。在贝尔塞克，德国人的记录详细记录了104名工作人员，其中包括大约20名党卫军，他们在不到10个月的时间里杀害了大约50万犹太人。在索比堡，他们杀害了20万到25万人。这些集中营在1942年春夏开始运作贫民区在德国占领的波兰，到处都是犹太人。一旦他们完成了他们的任务——用毒气谋杀，或者用万湖协议的话说，“在东部重新安置”——纳粹就关闭了集中营。在整个德占区数以千计的集中营和劳改营中，有六个灭绝营，全部位于德占区波兰欧洲．
在21个直接受到影响的国家中，大屠杀的影响因区域而异，年复一年。没有哪个地方的大屠杀比在匈牙利．发生了什么在几年德国发生在匈牙利的时间超过16周。作为德国的盟友，匈牙利加入了战争迫害但不允许驱逐匈牙利公民。1941年，外国犹太难民被驱逐出匈牙利，并在匈牙利被德国人枪杀锦'yanets-Podilskyy、乌克兰。1944年3月19日德国入侵匈牙利后，局势发生了巨大变化。到4月中旬，纳粹已将犹太人限制在犹太人聚居区。5月15日，驱逐行动开始，在接下来的55天里，纳粹用147列火车将43.7万多名犹太人从匈牙利驱逐到奥斯维辛。
德国的政策大相径庭巴尔干半岛盟友。在罗马尼亚主要是罗马尼亚人自己屠杀了该国的犹太人。然而，战争快结束时，当德国的战败几乎已成定局时，罗马尼亚政府发现活着的犹太人更有价值，他们可以被绑架勒索赎金，也可以被用作与西方打交道的筹码。保加利亚从邻国驱逐犹太人色雷斯而且马其顿但政府领导人在驱逐本土的保加利亚犹太人方面遭到了强烈反对，他们被视为同胞。
被德国占领丹麦拯救了大部分的犹太人瑞典1943年10月，他从海路出发。这在一定程度上是可能的，因为德国在丹麦的存在相对较少。此外,虽然反犹太主义在许多其他国家的普通人口中导致了与德国人的合作，犹太人是一个集成部分丹麦语文化．在这种独特的情况下，丹麦人道主义蓬勃发展。
在法国犹太人在法西斯意大利在东南的占领比犹太人更好维希法国在那里，投敌的法国当局和警察为人手不足的德国军队提供了必要的支持。在德国直接占领下的法国地区，犹太人的处境最糟糕。虽然意大利与德国结盟，但直到德国占领意大利北部后才被推翻，意大利人才参加大屠杀法西斯领袖贝尼托·墨索里尼在1943年。
在德国占领的整个领土上，犹太人的处境十分危急。他们资源贫乏，盟友稀少，面临着不可能的选择。一些人冒着生命危险前来营救。瑞典外交官拉乌尔•瓦伦堡抵达布达佩斯1944年7月9日，为了拯救匈牙利仅存的犹太人社区．在接下来的六个月里，他与其他中立外交官、梵蒂冈和犹太人一起努力，阻止最后一批犹太人被驱逐出境。在其他地方，法国胡格诺派村庄勒尚本(Le Chambon-sur-Lignon)成为了5000名犹太人的避难所。在德国占领的波兰，援助犹太人是非法的，这种行为将被处以死刑Zegota(援助犹太人委员会)拯救了同样数量的犹太男人、女人和孩子。由总部设在伦敦的波兰流亡政府资助涉及范围广泛秘密Zegota为他们提供藏匿地点、经济支持和伪造身份证件。
一些德国人，甚至是一些纳粹分子，反对对犹太人的谋杀，并向他们伸出援助之手。最有名的是奥斯卡·辛德勒他是一名纳粹商人，为了从战争中获利，他在德国占领的波兰建立了使用非自愿劳动力的业务。最终，他采取行动，保护他的犹太工人不被驱逐到灭绝营。在所有被占领的国家，都有人来拯救犹太人，为他们提供一个藏身之处，一些食物，或几天或几周的庇护所，甚至为他们提供帮助持续时间关于战争。大多数救援人员并不认为他们的行为是英雄行为，而是出于一种共同的人道意识而与犹太人联系在一起。以色列后来授予救援人员荣誉公民和纪念纪念馆，以色列犹太人大屠杀纪念馆。