脑干

上丘脑

上皮体主要由松果体它位于第三脑室的后侧中线。这个腺体合成褪黑激素酶对日光敏感。松果体在日光下活动的节律性变化表明松果体起到了生物钟的作用。

丘脑

的丘脑一直被认为是理解人类组织的关键中枢神经系统．它参与了大多数(但不是全部)感觉和运动信号到大脑特定区域的中继和分布脑皮层。所有类型的感受器产生的感觉信号通过复杂的途径投射到特定的中继核在丘脑中，它们被分离并系统地组织起来。接力核依次供应大脑皮层的初级和次级感觉区。丘脑核的感觉输入对于感觉系统或躯体系统和视觉系统是对侧的，听觉系统是双侧和对侧的，味觉和嗅觉系统是同侧的。

丘脑的感觉接力核，统称为ventrobasal复杂的输入内侧丘系(源自延髓)、脊柱丘脑束和三叉神经。其中的纤维提升终止于腹底复合体中心核心的束接收来自深层感觉受体的输入，而投射到外层的纤维接收来自皮肤受体的输入。这种深感觉和浅感觉的分离在腹基复合体向大脑皮层初级感觉区的投射中被保留下来。

的跖丘脑是由内侧和外侧膝状体，或核。植物纤维视神经结束于侧膝状体，由六个细胞组成薄层，或层，折叠成马蹄形结构。每个椎板代表一个完整的对侧视半野图。细胞的各层横向膝曲体通过视觉辐射投射到大脑皮层的视觉区域。内侧膝状体接收来自中脑下丘的听觉冲动，并将它们传递到颞叶的听觉区域。内侧膝状体的腹侧核呈层状并有张力组织;这部分投射到主要的听觉区域，并被精确地调谐。内侧膝状体的其他细分投射到围绕初级区域的次级听觉皮层带。

的大部分输出小脑投射到特定的丘脑中继核的模式类似于感觉输入。丘脑中继核反过来为大脑提供输入主运动区额叶。这个系统似乎提供了协调和控制的影响，导致适当的自主运动的力量、顺序和方向。另一方面，纹状体的输出由丘脑核传递，丘脑核可进入补充区和前运动区。的辅助电机区位于大脑半球的内侧，对初级运动区施加修饰性的影响，并似乎参与编程熟练的运动序列。的前运动区位于主运动区吻侧，在感觉引导运动中起作用。

其他主要的丘脑核包括前核群中背核，和枕骨核。前核群接收来自下丘脑的输入，并投射到边缘叶的部分区域(即扣带回)。背中核是内侧核群的一部分互惠与额叶吻侧的大部分连接到运动区。的枕核是一个后核复合体，与背中核一起向皮层的相关区域投射。

从网状结构脑干的神经传导到大脑皮层丘脑板内核，位于分离内侧和腹外侧丘脑核的椎板上。这个提升系统与唤醒机制有关，保持警觉性，并将注意力导向感官事件。

下丘脑

的下丘脑位于丘脑下方第三脑室的壁和底。它被称为穹窿的弯曲轴突束分为内侧和外侧两组，穹窿起源于海马结构并投射到乳腺体。下丘脑通过分泌激素(即催产素和抗利尿激素)会诱发平滑肌缩略语生殖，消化、排泄系统;其他神经内分泌神经元传递激素释放因子(例如，生长激素肾上腺皮质激素、促甲状腺激素和促性腺激素)经血管门静脉系统到达腺垂体的一部分脑下垂体．下丘脑的特定区域还涉及交感神经和副交感神经活动的控制、温度调节、食物摄入、生殖周期以及情绪表达和行为(见下文人类神经系统的功能:情感和行为)．

丘脑底部

下丘脑主要由丘脑核这是一种透镜状结构，位于下丘脑的后面和两侧以及内囊的背表面。丘脑下区域遍历与苍白球有关的纤维。丘脑下核产生的离散病变单侧抽搐这是一种剧烈的运动障碍，患者的四肢会不由自主地乱摆。

中脑

中脑(中脑)包含大脑的核复合体眼球运动的神经以及滑车神经核；这些颅神经使肌肉神经活动眼睛控制形状镜头直径学生．此外，在中脑网状结构(这里称为被盖层)和大脑小腿之间有一个大的色素核，称为黑质．黑质由两部分组成帕尔斯试和致密部．致密部细胞含有深色色素黑色素；这些细胞合成多巴胺投射到尾状核或壳核。通过抑制尾状核和壳核中的大棘状纹状体神经元的作用(在上述部分中描述)基底神经节)，致密部的多巴胺能细胞影响脑的输出神经递质来自刺状纹状体神经元的GABA。刺状神经元依次投射到网状部的细胞，网状部通过将纤维投射到丘脑，成为纹状体输出系统的一部分。

在中脑尾侧，是上脑的交叉纤维小脑脚(主要输出系统的小脑)环绕并部分终止于一个位于中心的大型结构，称为红核．这个束的大部分交叉上升纤维投射到丘脑核，丘脑核可以进入初级运动皮层。红色核尾部区域的大细胞上有少量纤维突触;这些纤维形成了交叉的红脊髓束纤维(看到一节脊髓:下行脊髓束)．的屋面板中脑的部分由两个成对的圆形肿块构成，即上丘和下丘。的上丘从视网膜视觉皮层参与各种视觉反射，特别是对侧视野中物体的追踪。的下丘接收交叉和未交叉的听觉纤维，并投射到内侧膝状体，即丘脑的听觉中继核。

脑桥

的脑桥(metencephalon)由两部分组成芽鳞，一个系统发育较老的部分，包含网状结构，和桥脑核，由大量神经元组成的较大部分，位于大束纵向和横向神经纤维之间。

起源于神经元的纤维大脑皮层终止于脑桥核，而脑桥核又投射到脑桥的另一个半球小脑．这些巨大的交叉纤维叫做大脑脚，形成小脑中梗，是连接每个大脑半球与小脑对半部分的桥梁。起源于大脑皮层的纤维构成的corticopontine束。

的网状结构桥脑被盖(见于中脑、桥脑和延髓的灰质内核)包含多种影响运动功能的细胞群。它还包含一些颅神经的核。的面部神经这两个分量蜗神经例如，在脑桥、髓质和小脑的交界处出现并进入脑干。此外，三叉神经的运动核位于桥上。连接大脑和脊髓的长长的上行和下行束位于外围脑桥的。